《虫图腾》改编自作者狼七的同名小说，讲述了民国时期，虫草堂名医潘俊与同为虫族五大家族后人相遇，得知祖上关于虫族宝藏的线索，从此踏上寻找族人遗留宝物的旅程。他们结伴而行，一起寻找能开启宝藏的五族秘宝，期间游历各地，探索祖上秘闻，一路上抗击瘟疫、打抱不平，眼看着离宝藏越来越近，却遭遇了盗宝者势力的打击，由此揭开了二十年前争夺宝藏的真相。他们也从最初对财富的渴望，渐渐背负起守护国家宝藏的使命，与盗宝者展开重重较量，最终粉碎了对方的贪婪之心，使传说中的虫族宝藏重见天日。在此过程中，他们学会了团队协作，结下了深厚的友情,以及发展了纯粹的爱情，从懵懂无知的少年成长为有责任感的英雄。
民国初年，中医世家后人潘俊年纪轻轻却善用虫类药，精通虫草药理，在北周城经营一家虫草堂药铺，打理百草园中的百种草药。因为医术高超，所以在邻里间享誉盛名。潘俊刀子嘴豆腐心，看病救人不收诊金，却要病号购买自
得知潘俊中蛊却不死的时淼淼惊奇不已，更加怀疑潘俊是木系家族后人的身份，于是监控潘俊的一举一动，等待时机报仇。时淼淼见到潘俊救治病人不遗余力，逐渐认为潘俊不是一个用水系族徽坑蒙拐骗的坏人，她犹豫之际，却
淼淼又一次见到潘俊为了治疗鼠疫亲自施针试药，却被南方地鳖虫给困住，无法救人，生在南方又豢养毒虫的水系家族，淼淼有这一味药，她同意给潘俊去找毒虫，治疗鼠疫。潘俊惊喜的得到淼淼送来的地鳖虫，完成了配药。水
燕云请潘俊去给自己弟弟看病，被欧阳雷火识别出潘俊是木系后人的身份，功夫高强的雷火怀疑是潘俊下毒毒害燕鹰，雷火要杀死潘俊，潘俊命悬一线。关键时刻，老管家潘璞说出潘俊是五大家族之首潘颖轩的儿子，燕鹰也被潘
潘俊和燕云都对父辈的婚约充满好奇，欧阳雷火讲述了二人父亲的往事。潘颖轩和欧阳烟雷两人一直不相信当年五大家族寻宝是自相残杀，他们认为是宝藏山体附近的自然环境特殊导致，所以传入了五大家族的禁地，被逐出虫族
燕云，燕鹰，子午在潘俊的说服下，决定加入五族的寻宝之旅，由于传说中说只有凑齐五大家族的秘宝才能找到宝藏，火系秘宝“墨玉”，土系秘宝“神匙”在手，于是潘俊开始四处打探水系秘宝的下落，水系秘宝玄冰古铁外表